Kumpulan kartano oli 1800-luvulla yksi suurimmista ja parhaiten hoidetuista tiloista Helsingin ympäristössä. Yli neljän neliökilometrin alueelle ulottunut tila muodostui Gumtäckt-nimisen kylän paikalle 1400-luvun lopulla. Kumpulan kartanolla oli vuosisatojen saatossa lukuisia omistajia. Kartano ei kulkenut suvussa polvelta seuraavalle, vaan siirtyi varsin tiuhaan aatelisilta omistajilta myös rikkaille aatelittomille, milloin nappulana velanmaksussa milloin pantattuna.

Kartano säilyi yksityisessä omistuksessa aina 1800-luvun lopulle asti. Viimeinen yksityinen omistaja oli vapaaherra Herman Standertskjöld-Nordenstam. Hänen aikana kartanotila kutistui, kun maita myytiin asuntorakentamisen tarpeisiin.

Helsingin kaupunki lunasti maat vuonna 1893, minkä jälkeen alue toimi maidontuottajana vuoteen 1905 asti. Tämän jälkeen kartanossa oli sukupuolitautien sairaala, joka lopetti toimintansa vuonna 1960 asti. Kansakoulu aloitti kartanossa, kunnes se lopetti peruskoulu-uudistuksen myötä vuonna 1977.

Kartano on siitä lähtien ollut Helsingin yliopiston hallinnassa. Kasvitieteellistä puutarhaa alettiin rakentaa 1980-luvulla ja se avattiin yleisölle vuonna 2009.